个人转让商品房，如何计算个人所得税应纳税额？
一、个人转让自用5年以上，并且是家庭唯一生活用房，取得的所得免征个人所得税；
二、个人出售自有住房取得的所得应按照“财产转让所得”项目征收个人所得税。 财产转让所得，以转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额，为应纳税所得额，按照“财产转让所得”项目缴纳个人所得税，税率为20%。
个人转让房屋的个人所得税应税收入不含增值税，其取得房屋时所支付价款中包含的增值税计入财产原值，计算转让所得时可扣除的税费不包括本次转让缴纳的增值税。
三、对转让住房收入计算个人所得税应纳税所得额时，纳税人可凭原购房合同、发票等有效凭证，经税务机关审核后，允许从其转让收入中减除房屋原值、转让住房过程中缴纳的税金及有关合理费用。
纳税人未提供完整、准确的房屋原值凭证，不能正确计算房屋原值和应纳税额的，税务机关可根据《中华人民共和国税收征收管理法》第三十五条的规定，对其实行核定征税，即按纳税人住房转让收入的一定比例核定应纳个人所得税额。具体比例由省级地方税务局或者省级地方税务局授权的地市级地方税务局根据纳税人出售住房的所处区域、地理位置、建造时间、房屋类型、住房平均价格水平等因素，在住房转让收入1%-3%的幅度内确定。
依据：
关于营改增后契税 房产税 土地增值税 个人所得税计税依据问题的通知
国家税务总局关于个人住房转让所得征收个人所得税有关问题的通知
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